Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sycp1Q62209 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms