Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxj1Q61660 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms