Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3Q60803 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3Q60803 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms