Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myh1Q5SX40 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms