Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11487Q5RIS0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms