Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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