Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ecm2Q5FW85 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms