Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Khdc1cQ4KL78 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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