Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pydc3Q3V3Q4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms