Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ulk4Q3V129 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms