Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
4930596D02RikQ3V0H9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms