Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc27Q3V036 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms