Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Prdm6Q3UZD5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Prdm6Q3UZD5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Prdm6Q3UZD5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Prdm6Q3UZD5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Prdm6Q3UZD5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Prdm6Q3UZD5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prdm6Q3UZD5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Prdm6Q3UZD5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prdm6Q3UZD5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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