Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnga4Q3UW12 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnga4Q3UW12 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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