Protein–RNA interactions for Protein: Q3UVD5

Lgr6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr6Q3UVD5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lgr6Q3UVD5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgr6Q3UVD5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms