Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm29609Q3UU56 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms