Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Znf48Q3US17 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Znf48Q3US17 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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