Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
D13Ertd608eQ3UPR8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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D13Ertd608eQ3UPR8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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