Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skap2Q3UND0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skap2Q3UND0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms