Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tmem253Q3UNB8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tmem253Q3UNB8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tmem253Q3UNB8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tmem253Q3UNB8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tmem253Q3UNB8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tmem253Q3UNB8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tmem253Q3UNB8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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