Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp30Q3UN04 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp30Q3UN04 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms