Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Parp3Q3ULW8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Parp3Q3ULW8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms