Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3UJP5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3UJP5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3UJP5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms