Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp19Q3UJD6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp19Q3UJD6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms