Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc34Q3UI66 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms