Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Q3U6N9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Q3U6N9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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