Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ulk3Q3U3Q1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms