Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms