Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem35bQ3U0Y2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms