Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Palb2Q3U0P1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Palb2Q3U0P1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms