Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc102aQ3TMW1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc102aQ3TMW1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms