Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp39Q3TIX9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp39Q3TIX9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp39Q3TIX9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp39Q3TIX9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp39Q3TIX9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp39Q3TIX9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp39Q3TIX9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp39Q3TIX9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp39Q3TIX9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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