Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc13Q3TIR1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms