Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam107bQ3TGF2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms