Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RubcnlQ3TD16 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms