Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Colec11Q3SXB8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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