Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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