Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
V1rd19Q3KNP5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms