Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rtl9Q32KG4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rtl9Q32KG4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rtl9Q32KG4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rtl9Q32KG4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rtl9Q32KG4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rtl9Q32KG4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rtl9Q32KG4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl9Q32KG4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl9Q32KG4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl9Q32KG4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl9Q32KG4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl9Q32KG4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl9Q32KG4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl9Q32KG4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl9Q32KG4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl9Q32KG4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl9Q32KG4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl9Q32KG4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl9Q32KG4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtl9Q32KG4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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