Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col24a1Q30D77 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms