Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

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Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gbp8Q2V6D6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gbp8Q2V6D6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gbp8Q2V6D6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gbp8Q2V6D6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gbp8Q2V6D6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gbp8Q2V6D6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gbp8Q2V6D6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gbp8Q2V6D6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gbp8Q2V6D6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gbp8Q2V6D6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp8Q2V6D6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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