Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cpne9Q1RLL3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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