Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ptcd3Q14C51 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ptcd3Q14C51 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptcd3Q14C51 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms