Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms