Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Itgb8Q0VBD0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Itgb8Q0VBD0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Itgb8Q0VBD0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Itgb8Q0VBD0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Itgb8Q0VBD0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Itgb8Q0VBD0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Itgb8Q0VBD0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Itgb8Q0VBD0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Itgb8Q0VBD0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itgb8Q0VBD0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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