Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cntnap5cQ0V8T7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cntnap5cQ0V8T7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cntnap5cQ0V8T7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cntnap5cQ0V8T7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cntnap5cQ0V8T7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cntnap5cQ0V8T7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5cQ0V8T7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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