Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn2bQ0KL01 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms