Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NeblQ0II04 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms