Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf541Q0GGX2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf541Q0GGX2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms