Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gata4Q08369 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms